根據通知的第一條規定，外貿企業自貨物報關出口之日起90天內未向主管稅務機關退稅部門申報出口退稅的貨物，除非另有規定或確有特殊原因經地市以上稅務機關批準外，需進行納稅申報并計提銷項稅額。對應稅消費品，還需要按照消費稅規定進行申報。

為方便出口企業計提銷項稅額或計算應納稅額，通知中明確了兩種納稅人的計算公式。對于一般納稅人，其銷項稅額可按如下公式計算：銷項稅額=（出口貨物離岸價格外匯人民幣牌?價）÷（1+法定增值稅稅率）。而對小規模納稅人，則需按照如下公式計算應納稅額：應納稅額=（出口貨物離岸價格外匯人民幣牌?價）÷（1+征收率）。

通知中還特別提到了以進料加工貿易方式出口并未按規定期限申報退稅的貨物。對于這種情況，出口企業需要根據復出口貨物的離岸價格與所耗用進口料件的差額，計提銷項稅額或計算應納稅額。

在通知的第四條中，對于出口企業提出延期申報退（免）稅的情況，主管稅務機關退稅部門除了按照國稅發〔2004〕64號文件第三條和國家稅務總局補充通知〔2004〕113號第一條規定執行外，還可以根據地市以上稅務機關核準后的期限內進行申報辦理。

為了切實落實上述規定，通知還要求各地稅務機關加強征稅與退稅環節的銜接，建立和完善征稅與退稅部門之間的溝通協調工作制度和管理。

針對以上問題，我們提出以下指導意見：首先，出口企業應加強自身管理，確保及時申報退（免）稅，并按照相關公式計算銷項稅額或應納稅額。同時，出口企業在遇到特殊情況無法按時申報時，應及時向稅務機關提出書面合理理由，并在核準的期限內辦理退（免）稅手續。

此外，稅務機關也應加強征稅與退稅環節的銜接，確保信息溝通暢通，及時解決出口企業在退稅過程中遇到的問題和困難。

對于出口企業退稅管理提供了明確的規定和指導意見。出口企業應自覺遵守相關規定，合理申報退（免）稅并按照公式計算稅額，稅務機關也應積極配合，確保征稅與退稅工作的順利進行。通過雙方的共同努力，將為我國出口企業的發展創造更好的稅收環境。